Untuk pembayaran biaya pendidikan SIT Fathona telah bekerjasama dengan bank-bank yang terpercaya di Indonesia, antara lain : Bank Syariah Indonesia dan Bank Mandiri. SIT Fathona telah menggunakan sistam Virtual Account (VA) dalam menerima bayaran biaya pendidikan. Dengan sistem VA, setiap siswa memiliki nomor rekening khusus yang dapat digunakan untuk membayar SPP, angsuran biaya masuk, daftar ulang dan biaya lainnya. Sistem ini akan memudahkan pihak wali siswa dan juga sekolah dalam memantau pembayaran biaya pendidikan anak di SIT Fathona.
Apabila ayah bunda wali siswa SIT Fathona belum mengetahui nomor Virtual Account (VA), maka bisa menghubungi admin di masing-masing cabang SIT Fathona untuk mendapatkannya.Β Bagi yang belum mengetahui tata cara pembayaran menggunakan Virtual Account, berikut kami hadirkan penjelasan tata cara pembayarannya.